Cierro las ventanas de mi casa por la noche. ¿Causa un aumento de CO2 y afecta a mi bebé?

No debe afectar, porque tenemos ventilación en nuestras habitaciones o baños. Además, las ventanas (de vidrio sobre madera) tienen una separación delgada, debido a que una cantidad muy pequeña de aire fresco continúa entrando a su habitación.
Una cosa más, si no tiene ventilación en la habitación, y si la tiene en su baño adjunto, mantenga la puerta del baño abierta (levemente abierta) por la noche, para que el oxígeno esté fácilmente disponible en su habitación.